数学与计算机学院是衡水学院创建最早的院系之一。其前身为1977年国家恢复高考招生制度，衡水地区师范学校受河北师范大学数学系委托招生的大专班。

1979年10月，衡水师范专科学校（简称“衡水师专”，衡水学院前身）成立。以数学大专班为基础，设立数学科。

1983年10月，经衡水地区行政公署批准，撤销数学科，正式设立数学系。

1995年-1997年，增设计算机教学班。

1999年，经河北省教育厅批准，设立“计算机教育”、“计算机应用与维护”两个专业。

2003年，“计算机应用与维护”专业停止招生。

2004年5月，教育部批准衡水师范专科学校升格改建为衡水学院，是衡水市唯一的一所全日制普通本科高等学校。数学系的“数学与应用数学”、“计算机科学与技术”专业升为四年制本科专业。

2005年，根据河北省教育厅关于衡水学院升本后设置教学机构的批复，数学系与公共计算机教学部合并，更名为数学与计算机科学系（简称仍为“数学系”）。同年，“计算机网络与技术”专业开始招生。

2007年，经河北省教育厅批准，设立“信息管理与信息系统”专业，并于同年开始招生（该专业于2008年划入经济管理系）。

2009年2月，衡水学院党委决定，在数学与计算机科学系基础上设置数学与计算机学院，简称“数计学院”。

2010年，“计算机教育”专业停止招生。

2013年，“数学教育”专业停止招生。

2014年，经河北省教育厅批准，设立“物联网工程”专业，并于同年开始招生。

2016年，经河北省教育厅批准，设立“应用统计学”专业，并于同年开始招生。

2018年，经河北省教育厅批准，设立“网络工程”专业，并于同年开始招生。

2020年，经河北省教育厅批准，设立“智能科学与技术”专业，并于同年开始招生。

2020年，经河北省教育厅批准，在衡水学院设立河北省人工智能现代产业学院，交由数计学院负责承办。

2021年，经教育部批准，衡水学院与美国中央密苏里大学合作举办“数学与应用数学”中外合作办学项目，于2022年开始招生。经衡水学院党委研究决定，由数计学院承担该项目的教学运行和日常管理。

2023年2月，经衡水学院党委常委会会议审议通过，并报请市委编办核准、省委编办备案，数学与计算机科学系更名为数学与计算机学院。